中控从浙大海纳退出进程中，褚健运用担任浙大工程基地副主任，海纳中控公司董事、总司理，科研项目担任人等职务便当，经过贱价转让股权等手法并吞、骗得公款，合计六千多万余元。检方指控的具体实际由三次股权转让构成。其一，时任海纳中控公司董事、总司理的褚健，抉择将海纳中控持有的中控技术股权贱价转让给本来践一切的中控科技。二零零二年七月九号日，两家公司签定股权转让协议，海纳中控依照一比一点二的报价，将其所持股权以三百六十万元的报价转让。
其二，海纳中控将其持有的浙大中控自动化外表有限公司40%的股权，依照1∶5.33的报价、以213.2万元转让给中控科技。其三，褚健实践一切的中控科技公司，同浙大工程基地达到股权转让协议，后者以300万元贱价将其持有的股权转让给中控科技。中控集团向新京报记者出具了上述三项转让根据，包含海纳中控的董事会抉择、浙江大学国有资产处理单位等单位的文书等。不过，根据1991年施行的国有资产评估处理方法及其细则，超越100万元的国有资产转让应当进行评估，这三起股权转让并没有经过此环节。
检方据此以为褚健“经过贱价转让股权等手法并吞、骗得公款”、涉嫌贪婪罪。公诉方指控称，经断定，上述三项转让的股权在报价断定基准日(2003年1月22日)的报价别离为2619.23万元、519.24万元和2619.23万元。检方断定报价与实践转让报价相差悬殊，这是此前有媒体在报导中，提及褚健“涉嫌掏空浙大”的由来。不过，褚健一方对检方的报价断定方法提出质疑。 律师称，检方这次报价断定中选用的收益断定法——依照当下中控的股权价值，核算当年股权的收益。说，依照检方指控的逻辑，中控办得越成功，褚健的“罪”就越大;“假设中控破产倒闭了，是不是褚健就无罪了?”
通知新京报记者，他预备为褚健做无罪辩解。由于有关股权转让经过了公司董事会及校园有关有些同意，合法合规。至于没有经过国有资产评估，职责也不在褚健，由于他是受让方。并且从其时浙大转让其部属公司股权的实例来看，大都均未经过国有资产评估程序。
